菖蒲剪的越短，越容易削弱植株长势，对生长不利。一般来说，剪去不超过2/3的叶片数量，这样可以保证植株不会被伤害。因此，菖蒲剪到一定长度后，就可以按需定时修剪。也就是说，并不是越剪越短就越好，应根据植株需要和生长状态来剪枝，并留下一定存活能力的茎叶，以保护植物的健康生长。所以，剪菖蒲要量力而行，适度修剪，以避免植株长势削弱。
菖蒲盆景发霉是因为环境湿度过高，所造成的，最好的处理方法是改善其生长环境，可以将其移至通风良好的地方，避免阳光直射，但仍需保持充足的光照，定时通风并保持适量湿度，避免积水，加强护理管理，注意经常清除落叶和烂根，避免烂根给影响到其它根部减少营养，可用泡过小苏打水后的湿毛巾清洁，或喷洒稀释过的酒精除霉剂，这样能有效地防止和处理菖蒲盆景发霉。