根据中国的法律规定，一个营业执照可以开设多个店铺。在小红书的情况下，他们可能通过在不同地区或城市注册分支机构的方式来开设三个店铺。每个分支机构都会有独立的经营范围和经营地址，但归属于同一个公司。这样做的好处是可以更好地覆盖不同地区的用户需求，提高品牌知名度和市场份额。
同时，这也需要遵守相关的法律法规，如税务、劳动等方面的规定。
在小红书上为一个订单填写两个快递单号通常涉及到合并发货的操作。根据找到的信息，如果你的小红书店铺满足特定条件，你可以申请使用合并发货功能。这些条件包括：
1. 拥有多个店铺并且需要合并发货。
2. 使用小红书ark系统操作发货。
3. 物流模式为red box（包括小包转运及一单到底）或自主发货。
申请合并发货的方式通常是通过联系小红书物流部对接人员或者通过juno工单系统—商服通道—物流类—发货规则咨询，联系商服团队协助办理。
在操作上，你可以在待打包状态看到此发货组下所有店铺的待发货包裹，并可以选择需要合并发货的店铺。完成配货的包裹在打包中状态上传，系统会增加校验，确保包裹属于此发货组下的店铺才能导入。
需要注意的是，这些信息可能不完全适用于所有情况，因为具体的操作步骤和要求可能因小红书平台政策的变化而有所不同。建议直接联系小红书的客服或访问其官方网站获取最新的操作指南和帮助。